MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 2

Total Repeats: 357

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017962	AT	3	6	382	387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017962	TAAA	2	8	479	486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017962	TCC	2	6	1202	1207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017962	TAT	2	6	1221	1226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017962	TAG	2	6	1241	1246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017962	AGG	2	6	1483	1488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017962	A	6	6	2224	2229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017962	AGC	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017962	A	7	7	2254	2260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017962	A	6	6	2329	2334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017962	A	6	6	2347	2352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017962	AAG	2	6	2382	2387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017962	TAAC	2	8	2519	2526	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017962	ATT	2	6	3017	3022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017962	A	6	6	3058	3063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017962	TTTAT	2	10	3068	3077	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017962	AC	3	6	3081	3086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017962	TAAAA	2	10	3087	3096	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017962	A	6	6	3107	3112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017962	CT	3	6	3520	3525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017962	T	6	6	3525	3530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017962	CAC	2	6	6336	6341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017962	TATT	2	8	6345	6352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017962	TC	3	6	6363	6368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017962	AAT	2	6	6384	6389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017962	TAA	2	6	6394	6399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017962	AGG	2	6	6402	6407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017962	A	6	6	6688	6693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017962	T	6	6	6703	6708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017962	CAA	2	6	6718	6723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017962	T	7	7	6780	6786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017962	AG	3	6	9265	9270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017962	T	7	7	9288	9294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017962	CTT	2	6	9323	9328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017962	AAG	2	6	9377	9382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017962	CCT	2	6	9415	9420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017962	TTA	2	6	9453	9458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017962	A	6	6	9465	9470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017962	TG	3	6	9478	9483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017962	GTT	2	6	9511	9516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017962	CTA	2	6	9592	9597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017962	AAT	2	6	9611	9616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017962	AGG	2	6	9630	9635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017962	TTTA	2	8	10352	10359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017962	ATA	2	6	10756	10761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017962	CTC	3	9	10810	10818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017962	TCA	2	6	10821	10826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017962	ATT	2	6	11138	11143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017962	ATA	3	9	11153	11161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017962	AGCA	2	8	11180	11187	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017962	AAG	2	6	11198	11203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017962	TTCC	2	8	12759	12766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017962	AAT	2	6	12786	12791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017962	TA	4	8	12851	12858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017962	A	6	6	12873	12878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017962	ACGA	2	8	12973	12980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017962	GTT	2	6	12990	12995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017962	GAA	2	6	13011	13016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017962	T	6	6	13033	13038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017962	T	6	6	13048	13053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017962	TAT	2	6	13059	13064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017962	AAG	2	6	13099	13104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017962	TAA	2	6	13111	13116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017962	TAAA	2	8	13132	13139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017962	ATT	2	6	13167	13172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017962	TAA	2	6	13205	13210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017962	ACA	2	6	13240	13245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017962	TAA	2	6	13304	13309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017962	TTG	2	6	13322	13327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017962	A	6	6	13336	13341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017962	TG	3	6	13878	13883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017962	TCC	2	6	13937	13942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017962	TAG	2	6	14037	14042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017962	AGC	2	6	14050	14055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017962	AGG	2	6	14161	14166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017962	CTT	2	6	14169	14174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017962	A	8	8	15464	15471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017962	TTTGAT	2	12	15472	15483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017962	CTTT	2	8	16392	16399	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017962	TTTA	2	8	16404	16411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017962	TA	3	6	16422	16427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017962	TTTAT	2	10	16428	16437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017962	ATTT	2	8	16443	16450	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017962	TA	3	6	16458	16463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017962	AT	3	6	16484	16489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017962	AT	3	6	16493	16498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017962	AT	3	6	16523	16528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017962	AAT	2	6	16538	16543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017962	AAT	2	6	16572	16577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017962	TGT	2	6	17785	17790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017962	T	6	6	17820	17825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017962	AT	3	6	17856	17861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017962	A	6	6	17898	17903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017962	AAT	2	6	17924	17929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017962	TTAA	2	8	17950	17957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017962	TAT	2	6	17975	17980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017962	AT	3	6	17984	17989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017962	AT	3	6	18002	18007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017962	TTA	2	6	18008	18013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017962	TATTT	2	10	18023	18032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017962	ACA	2	6	18047	18052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017962	A	7	7	18082	18088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017962	TTAA	2	8	18135	18142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017962	TAT	2	6	18160	18165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017962	TAA	2	6	18208	18213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017962	A	7	7	18242	18248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017962	T	7	7	18284	18290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017962	AGA	2	6	20033	20038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017962	ATT	2	6	20059	20064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017962	GAA	2	6	20073	20078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017962	CAA	2	6	20087	20092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017962	A	7	7	20099	20105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017962	AGA	3	9	20117	20125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017962	A	7	7	22361	22367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017962	ACA	2	6	22374	22379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017962	ACT	2	6	22899	22904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017962	AT	3	6	22915	22920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017962	CAT	2	6	22950	22955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017962	GT	3	6	22996	23001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017962	ATT	2	6	23668	23673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017962	CAA	2	6	23838	23843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017962	GGTA	2	8	23902	23909	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017962	GCTGA	2	10	23952	23961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017962	GTA	2	6	24036	24041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017962	TGT	2	6	25085	25090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017962	ACAATT	2	12	25107	25118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017962	T	6	6	25117	25122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017962	TA	3	6	25129	25134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017962	ACGA	2	8	25155	25162	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017962	TAA	2	6	25171	25176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017962	CCA	2	6	25210	25215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017962	AT	4	8	25232	25239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017962	TAAAA	2	10	25249	25258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017962	CT	3	6	26045	26050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017962	TA	3	6	26064	26069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017962	TTTA	2	8	26078	26085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017962	GAATA	2	10	26088	26097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017962	T	6	6	26114	26119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017962	CAA	2	6	26821	26826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017962	CGG	2	6	26835	26840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017962	TCA	2	6	26877	26882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017962	GCC	2	6	27009	27014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017962	GAT	2	6	27021	27026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017962	TCT	2	6	27034	27039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017962	AGA	2	6	27041	27046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017962	T	7	7	27055	27061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017962	A	6	6	27084	27089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017962	ATAC	2	8	27127	27134	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017962	T	7	7	29151	29157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017962	ATAG	2	8	29169	29176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017962	TTTC	2	8	29275	29282	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017962	G	7	7	29302	29308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_017962	T	6	6	29382	29387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_017962	AC	3	6	57065	57070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
301	NC_017962	ATT	2	6	57073	57078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_017962	A	6	6	57106	57111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
303	NC_017962	AGA	2	6	59047	59052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017962	A	7	7	59068	59074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_017962	CTT	3	9	59100	59108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
306	NC_017962	TAAT	2	8	59144	59151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017962	TAA	2	6	59161	59166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_017962	CATT	2	8	61574	61581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
333	NC_017962	TAAA	2	8	61628	61635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_017962	TTAT	2	8	62219	62226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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337	NC_017962	CTT	2	6	62742	62747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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341	NC_017962	CA	3	6	62868	62873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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356	NC_017962	AT	3	6	66176	66181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
357	NC_017962	CCT	2	6	66195	66200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.